وحدة الرقابة والتدقيق الداخلي هي أحد أهم الدوائر الرقابية الفعالة التي تستخدمها إدارة الجامعة في الرقابة على أعمال وأنشطة الجامعة من خلال التحقق من تطبيق تعليمات وسياسات وأنظمة الجامعة وكذلك الرقابة على آداء الموظفين للتأكد من سلامة قيامهم بواجباتهم طبقاً للسياسات والتعليمات والانظمة الموضوعة ما يحافظ على أصول وممتلكات الجامعة بفاعلية أكبر وتحقيق أهدافها المنظورة .