لدى وحدة الرقابة والتدقيق الداخلي خطة شاملة لتدقيق الانشطة المالية والادارية في الجامعة وتعتمد هذه الخطة على برنامج تدقيق داخلي يهدف في نهاية الامر إلى تمكين الادارة من تحقيق الاشراف والرقابة والمتابعة على أوجه نشاطات الجامعة وفرض رقابة على أعمال الموظفين للتحقق من قيامهم بأعمالهم وواجباتهم طبقاً للسياسات والتعليمات الموضوعة